Tali puupuu: O le Generative AI e faatelevaveina tele le mauaina vave o fualaau faasaina e ala i le gaosia o molela po o faasologa o porotini, fautuaina o auala e faia ai, ma faaalia ai ni manatu e mafai ona tofotofoina, ina ia mafai ai e 'au ona faatino ni nai faataitaiga "tauaso". E sili ona lelei lona faatinoga pe a e faamalosia ni tapulaa faigata ma faamaonia taunuuga; a taulimaina e pei o se vavalo, e mafai ona taitaiseseina ma le mautinoa.
Manatu autū:
Fa'avavevaveina : Faaaoga le GenAI e fa'alautele ai le fatuina o manatu, ona fa'aitiitia lea i le fa'amamāina lelei.
Tapula'a : Mana'omia tulaga o meatotino, tulafono fa'avae, ma tapula'a fou a'o le'i faia.
Fa'amaoniga : Taulima ia taunuuga o ni manatu fa'avae; fa'amaonia i su'ega ma fa'ata'ita'iga orthogonal.
Su'esu'ega : Fa'amatalaga e fa'amaumau ai fa'amatalaga, taunu'uga, ma mafua'aga ina ia mafai ona su'esu'eina ma toe iloiloina fa'ai'uga.
Tete'e i le fa'aaogā sese : Puipuia le sosolo ese ma le soona talitonuina o fa'amatalaga i le pulega, pulega o avanoa, ma le iloiloga a tagata.

O tala e te ono fia faitauina pe a uma lenei:
🔗 Le matafaioi a le AI i le tausiga o le soifua maloloina
Auala e faʻaleleia ai e le AI le suʻesuʻega, faiga o galuega, tausiga o maʻi, ma taunuuga.
🔗 O le a suia e le AI le au suʻesuʻe radiology?
Su'esu'e pe fa'apefea ona fa'aleleia e le otometi le radiology ma mea e tumau pea i le tagata.
🔗 O le a suia ea e le AI foma'i?
O se vaaiga faamaoni i le aafiaga o le AI i galuega ma faiga a fomaʻi.
🔗 Meafaigaluega sili ona lelei a le AI i le fale suʻesuʻe mo suʻesuʻega faasaienisi
Meafaigaluega sili ona lelei i le fale suʻesuʻe AI e faʻavavevave ai faʻataʻitaʻiga, auʻiliʻiliga, ma le mauaina.
O le matafaioi a le AI fa'atupuina i le Sailiga o Fualaau Fa'asaina, i le manava e tasi 😮💨
E fesoasoani le Generative AI i 'au fa'afoma'i e fatu ni molela'au fou, vavalo i meatotino, fautuaina ni suiga, fautuaina ni auala e fa'atupu ai, su'esu'e ni manatu fa'aolaola, ma fa'apu'upu'u ni ta'amilosaga fa'asolosolo - aemaise lava i le amataga o le mauaina ma le fa'aleleia atili o le ta'ita'iga. Nature 2023 (iloiloga o le mauaina o le ligand) Elsevier 2024 iloiloga (fa'ata'ita'iga fa'atupuina i le mamanu o vaila'au fou)
Ioe, e mafai fo'i ona fa'atupuina ma le mautinoa ni mea le aoga. O se vaega lea o le fefa'ataua'iga. E pei o se tagata a'oa'o fiafia tele ma se afi roketi. Taiala a foma'i (lamatiaga o mafaufauga leaga) npj Digital Medicine 2025 (fa'avae o mafaufauga leaga + saogalemu)
Aiseā e sili atu ai ona tāua lenei mea nai lo le mea e ta'utino mai e tagata 💥
O le tele o galuega suʻesuʻe o le "sailiga." Saili le vateatea vailaʻau, saili le biology, saili tusitusiga, saili sootaga fausaga-galuega. O le faʻafitauli o le vateatea vailaʻau e... e le gata mai. Tala o Suʻesuʻega Kemikolo 2015 (vateatea vailaʻau) Irwin & Shoichet 2009 (fuafuaga o le vateatea vailaʻau)
E mafai ona e faaaluina le tele o olaga i le na o le taumafai i ni suiga "talafeagai".
E suia e le Generative AI le faiga o galuega mai:
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“Se’i o tatou fa’ata’ita’i po o le a se mea e mafai ona tatou mafaufau i ai”
i le:
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"Se'i o tatou faia ni filifiliga tetele ma atamai, ona tatou fa'ata'ita'i lea o filifiliga sili ona lelei"
E lē o le fa'aumatia o fa'ata'ita'iga. Ae o le filifilia o fa'ata'ita'iga sili atu . 🧠 Nature 2023 (iloiloga o le mauaina o le ligand)
E le gata i lea, ma e le o tele se talanoaga e uiga i lenei mea, e fesoasoani i 'au e talanoa i matā'upu eseese . O foma'i vaila'au, tagata su'esu'e meaola, tagata DMPK, saienitisi fa'akomepiuta… e eseese fa'ata'ita'iga mafaufau o tagata uma. O se faiga fa'atupuina lelei e mafai ona avea o se ata fa'asoa. Iloiloga o Tuaoi i le Sailiga o Fualaau Fa'asaina 2024
O le ā le mea e avea ai ma se fa'aliliuga lelei o le generative AI mo le sailia o vaila'au? ✅
E lē tutusa uma le fatuina o AI fa'atupuina. O se fa'aliliuga "lelei" mo lenei avanoa e itiiti ifo i fa'ata'ita'iga mata'ina ae sili atu i le fa'atuatuaina e le manaia (o le le manaia o se uiga lelei iinei). Nature 2023 (iloiloga o le mauaina o le ligand)
O se faʻatulagaga lelei o le AI generative e masani ona i ai:
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Fa'avaeina o le 'upega tafa'ilagi : a'oa'oina pe fetu'una'i i fa'amaumauga vaila'au, fa'aolaola, ma fa'afoma'i (e le na'o tusitusiga lautele) 🧬 Iloiloga o Elsevier 2024 (fa'ata'ita'iga fa'atupuina)
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Fa'atapula'aina-tupulaga muamua : e mafai ona usita'ia tulafono e pei o le lipophilicity ranges, scaffold constraints, binding site features, selectivity goals JCIM 2024 (diffusion models in de novo drug design) REINVENT 4 (open framework)
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Malamalama i meatotino : e faʻatupuina ai ni molelaʻau e le gata ina fou ae "e le valea" foʻi i faaupuga ADMET ADMETlab 2.0 (aisea e taua ai le amataga o le ADMET)
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Lipotiina o le le mautinoa : e fa'ailoa mai ai pe a mate'i pe a mautu (e o'o lava i se fusi fa'atuatuaina e le'i manino lelei e fesoasoani) Mataupu fa'avae o le fa'amaoniga a le OECD QSAR (vaega fa'aoga)
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Pulea e le tagata i totonu o le li'o : e mafai e le au fa'akemikolo ona fa'atonutonu, teena, ma ta'ita'ia vave mea e maua mai Natura 2023 (fa'asologa o galuega + fa'amatalaga fa'atekinolosi o su'esu'ega)
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Su'esu'ega : e mafai ona e iloa le mafua'aga na tupu ai se fautuaga (ia le itiiti ifo ma se vaega), pe o lo'o e le amana'ia le ta'iala tauaso a le OECD QSAR (fa'ata'ita'iga manino + fa'amaoniga)
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Mea e fa'aaoga mo le iloiloga : fa'apipi'iina, QSAR, faamama, siaki o le retrosynthesis - ua uma ona fa'apipi'iina i le 🔧 Nature 2023 (iloiloga o le mauaina o le ligand) A'oa'oga Masini i le CASP (Coley 2018)
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Puleaina o le fa'aitu'au ma le tafega : ina ia 'alofia ai le taulotoina o fa'amatalaga o a'oa'oga (ioe, e tupu lava) USENIX 2021 (ave'esea o fa'amatalaga o a'oa'oga) Vogt 2023 (popolega i mea fou/tulaga ese)
Afai e le mafai e lau AI fa'atupuina ona taulimaina ni fa'atapula'a, e pei lava o se mea fou e gaosia. Fiafia i pati. E itiiti le fiafia i se polokalame fa'asaina.
O fea e fetaui ai le AI gaosia i totonu o le auala e suʻesuʻe ai fualaau faʻasaina 🧭
O le fa'afanua faigofie lea o le mafaufau. E mafai e le Generative AI ona fesoasoani i toetoe lava o la'asaga uma, ae e sili ona lelei le fa'atinoga pe a taugata le toe fa'ata'ita'iga ma tele le avanoa o le manatu. Nature 2023 (iloiloga o le mauaina o le ligand)
Nofoaga masani e fesootaʻi ai:
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Mauaina ma le fa'amaoniga o sini (manatu, fa'afanua o auala, fautuaga o fa'ailoga o meaola) Iloiloga o Tuaoi i le Mauaina o Fualaau Fa'asaina 2024
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Fa'ailoaina o A'afiaga (fa'ateleina o le su'esu'ega fa'apitoa, fa'atupuina o aafiaga fou) Nature Biotechnology 2019 (GENTRL)
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Fa'aleleia atili o le ta'ita'iga (fautuaina o analogs, fa'atulagaina o le tele o parakalafa) REINVENT 4
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Lagolago muamua i togafitiga faafoma'i (valo'aga o meatotino a le ADMET, fa'amatalaga i le fa'atulagaina o nisi taimi) ADMETlab 2.0
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Fuafuaga o le CMC ma le fa'asologa (fautuaga mo le retrosynthesis, fa'avasegaina o auala) AiZynthFinder 2020 Coley 2017 (retrosynthesis fesoasoani i le komepiuta)
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Galuega o le malamalama (tu'ufa'atasiga o tusitusiga, aotelega o le siosiomaga tauvaga) 📚 Mamanu 2025 (LLM i le sailiga o vaila'au)
I le tele o polokalame, o manumalo tetele e sau mai le tu'ufa'atasia o le faiga o galuega , ae le o se fa'ata'ita'iga e tasi e "atamai." O le fa'ata'ita'iga o le afi - o le paipa o le ta'avale. Nature 2023 (iloiloga o le sailiga o le ligand)
Laulau Fa'atusatusaga: auala lauiloa o le AI fa'atuputupu a'e e fa'aaogaina i le sailia o vaila'au 📊
O se laulau e fai si le atoatoa, aua o le olaga moni e fai si le atoatoa.
| Meafaigaluega / Auala | Sili mo (le aofia) | Tau fa'atatau | Aiseā e aogā ai (ma pe a lē aogā) |
|---|---|---|---|
| O masini fa'atupu molela'au fou (SMILES, kalafi) | Kemisi faafoma'i + kemisi fa'atusatusa | $$-$$$ | Lelei tele i le su'esu'eina vave o mea fou fa'atusa 😎 - ae mafai ona fa'aalia mea e le fetaui lelei ma le malosi REINVENT 4 GENTRL (Nature Biotech 2019) |
| Mea e gaosia ai porotini / fausaga | 'Au fa'aolaola, fa'atulagaga o le paiolo | $$$ | Fesoasoani e fautuaina ni fa'asologa + ni fausaga - ae o le "foliga mai e talafeagai" e le tutusa ma le "galue" AlphaFold (Nature 2021) RFdiffusion (Nature 2023) |
| Fuafuaga fa'a-molekula fa'asalalau | 'Au ML fa'apitoa | $$-$$$$ | Malosi i le fa'atulagaina o tapula'a ma le eseesega - e mafai ona avea le fa'atulagaga ... o se mea atoa JCIM 2024 (fa'ata'ita'iga fa'asalalau) Iloiloga o le fa'asalalauina o le PMC 2025 |
| Pailate fesoasoani i le vavaloina o meatotino (QSAR + GenAI combo) | DMPK, 'au o le poloketi | $$ | Lelei mo le fa'avasegaina ma le fa'atulagaina - leaga pe a fa'atatauina e pei o se talalelei 😬 OECD (vaega fa'aoga) ADMETlab 2.0 |
| Fuafuaga o le toe fa'afouina o le fausaga | Kemisi fa'agasologa, CMC | $$-$$$ | Fa'avavevaveina le fuafuaina o se auala - e mana'omia pea tagata mo le faigofie ma le saogalemu AiZynthFinder 2020 Coley 2018 (CASP) |
| Pailate fa'atasi i le fale su'esu'e tele-fa'avaega (tusitusiga + fa'amaumauga o su'ega) | 'Au fa'aliliu | $$$ | Fesoasoani mo le tosoina o fa'ailoilo i luga o fa'amaumauga - e faigofie ona soona mautinoa pe afai e le atoatoa fa'amaumauga Nature 2024 (aafiaga fa'aputuga i le ata o sela) npj Digital Medicine 2025 (multimodal i biotech) |
| Fesoasoani i tusitusiga ma manatu faavae | Tagata uma, i le faʻatinoina | $ | E fa'aitiitia tele ai le taimi e faitau ai - ae e mafai ona maseesee mafaufauga fa'alilolilo, e pei o le mou atu o totini . Mamanu 2025 (LLM i le mauaina o vaila'au) Taiala a foma'i (manatu fa'alilolilo) |
| Fa'ata'ita'iga fa'avae fa'apitoa i totonu o le fale | Kamupani tetele fa'afoma'i, fa'atekonolosi fa'atekonolosi ua fa'atupeina lelei | $$$$ | Pulea sili + tu'ufa'atasiga - e taugata fo'i ma e gesegese ona fausia (fa'amolemole, e moni) Iloiloga o le Frontiers in Drug Discovery 2024 |
Fa'amatalaga: e matuā eseese lava tau e fuafua i le tele, komepiuta, laisene, ma pe mana'o lau 'au e "plug and play" pe "se'i o tatou fausia se va'a i le vateatea."
Va'aiga toto'a: Fa'amatalaga Fa'atupuina (AI) mo le sailiga manuia ma le mamanu fou 🧩
O le faʻaaogaina autū lea: faʻatupuina ni molelaʻau sui mai le amataga (pe mai se fausaga) e fetaui ma se faʻasologa o sini. Nature Biotechnology 2019 (GENTRL) REINVENT 4
O le auala e masani ona galue ai i le faʻatinoga:
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Fa'amatala tapula'a
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vasega fa'atatau, foliga o le taga fusifusia, ligands ua iloa
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vaega o meatotino (solubility, logP, PSA, ma isi) Lipinski (Tulafono o le 5 o le anotusi)
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tapula'a fou (alo'ese mai sone IP ua iloa) 🧠 Vogt 2023 (iloiloga fou)
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Fausia ni sui tauva
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osooso fa'asitepu
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tuputupu aʻe o fasi vaega
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Fautuaga mo le "teuteuina o lenei totonugalemu"
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gaosiga e tele-fa'amoemoega (fusi + permeable + e le o'ona) REINVENT 4 Elsevier 2024 iloiloga (fa'ata'ita'iga fa'atupuina)
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Fa'amama malosi
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tulafono o le kemisi faafoma'i
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PAINS ma faamama o vaega tali atu Baell & Holloway 2010 (PAINS)
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siaki o le gafatia o le fa'asologa AiZynthFinder 2020
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fa'apipi'i / togi (le atoatoa ae aoga) Nature 2023 (iloiloga o le mauaina o le ligand)
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Filifili se seti laʻititi mo le faʻaputuga
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e filifili pea tagata, auā e mafai e tagata ona sogisogi i mea lē aogā i nisi taimi
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O le mea moni faigata: o le taua e le na o ni "molekuli fou." O ni molekuli fou e talafeagai mo tapula'a o lau polokalame . O le vaega mulimuli lena o mea uma. Natura 2023 (iloiloga o le mauaina o le ligand)
E le gata i lea, o le soona fai atu o se faamatalaga: afai e faia lelei, e foliga mai ua e faafaigaluegaina se 'au o tagata tomai faapitoa i vailaau e le vaivai e le moe ma e le faitio. Ae ui i lea, latou te le malamalama foi pe aisea e avea ai se fuafuaga faapitoa o se miti leaga, o lea… paleni 😅.
Va'aiga toto'a: Fa'aleleia atili o le ta'ita'iga ma le generative AI (multi-parameter tuning) 🎛️
O le fa'aleleia atili o le ta'ita'iga o le mea lea e faigata ai miti.
Ete mana'o:
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malosi ua si'itia
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filifiliga ua si'itia
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siitia le mautu o le metabolism
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fa'ateleina le mafai ona solo
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ua fa'aitiitia faailoilo saogalemu
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permeability "sa'o lelei"
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MA e mafai lava ona tuufaatasia
O le fa'aleleia atili masani lea o le tele o sini. E matua lelei lava le Generative AI i le fautuaina o se seti o fofo fa'atauva'a nai lo le fa'afoliga o lo'o i ai se tasi tu'ufa'atasiga atoatoa. le REINVENT 4 Elsevier 2024 (fa'ata'ita'iga fa'atupu)
Auala aogā e faʻaaogaina ai e 'au:
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Fautuaga fa'atusa : “Fai ni ituaiga e 30 e fa'aitiitia ai le fa'amamaina ae fa'atumauina le malosi”
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Su'esu'ega fa'aopoopo : su'esu'ega fa'atonutonu nai lo le fa'amaumauga fa'amalosi
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Feosofi o le fa'avae : pe a pa'i se ogatotonu i se puipui (tox, IP, po'o le mautu)
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Fautuaga fa'amatala : "O lenei vaega polar atonu e fesoasoani i le solubility ae ono afaina ai le permeability" (e le sa'o i taimi uma, ae aoga)
Tasi le lapata'iga: e mafai ona maaleale fa'amatalaga o meatotino. Afai e le fetaui au fa'amaumauga o a'oa'oga ma lau fa'asologa o vaila'au, e mafai ona sese ma le mautinoa le fa'ata'ita'iga. E pei lava, e matua sese lava. Ma o le a le maasiasi. OECD QSAR validation principles (applicability domain) Weaver 2008 (QSAR domain of applicability)
Va'aiga toto'a: ADMET, mea oona, ma le su'esu'ega o le "fa'amolemole aua le fa'aumatia le polokalame" 🧯
O le ADMET e tele ai sui tauva e lē manuia. O le Generative AI e lē foia ai le biology, ae e mafai ona faʻaitiitia ai mea sese e mafai ona ʻalofia. ADMETlab 2.0 Waring 2015 (attrition)
Matafaioi masani:
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vavaloina o noataga tau metabolism (nofoaga o le metabolism, aga masani o le fa'amamaina)
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fa'ailogaina o mafua'aga e ono a'afia ai mea oona (lapata'iga, sui o vaila'au tali atu)
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fuafuaina o le solubility ma le permeability ranges
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fautuaina ni suiga e faʻaitiitia ai le lamatiaga o le hERG pe faʻaleleia atili ai le mautu 🧪 FDA (ICH E14/S7B Q&A) EMA (ICH E14/S7B overview)
O le mamanu sili ona aoga e foliga faapenei: faaaoga le GenAI e fautua mai ai ni filifiliga, ae faaaoga foi faataitaiga faapitoa ma faataitaiga e faamaonia ai.
O le Generative AI o le afi e fa'atupu ai manatu. O lo'o tumau pea le fa'amaoniga i su'ega.
Va'aiga toto'a: Generative AI mo su'esu'ega fa'anatura ma polotini 🧬✨
E lē gata o ni molelaiti laiti le mauaina o fualaau faasaina. E faʻaaogaina foʻi le Generative AI mo:
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gaosiga o le faasologa o antibody
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fautuaga mo le matua o le mafutaga vavalalata
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fa'aleleia atili o le mautu o porotini
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inisinia enzyme
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suʻesuʻega o togafitiga peptide ProteinMPNN (Saienisi 2022) Rives 2021 (faʻataʻitaʻiga gagana porotini)
E mafai ona malosi le gaosiga o porotini ma le faasologa ona o le "gagana" o faasologa e matua fetaui lelei lava ma metotia ML. Ae o le tala lea e le masani ai: e fetaui lelei lava... seia vagana ua leai. Aua o le puipuiga o le tino, le fa'aalia, mamanu o le glycosylation, ma tapula'a o le atina'eina e mafai ona matua faigata lava. AlphaFold (Nature 2021) ProteinGenerator (Nat Biotech 2024)
O lea la, o filifiliga sili ona lelei e aofia ai:
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faamama o le atina'eina
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togi o lamatiaga o le puipuiga o le tino
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tapula'a o le gaosiga
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matasele su'esu'e susu mo le vave fa'ata'ita'iga 🧫
Afai e te misia na mea, e te maua se faasologa matagofie e amio e pei o se diva i le gaosiga.
Va'aiga toto'a: Fuafuaga o le fa'asologa ma fautuaga mo le toe fa'asologa 🧰
O loʻo faʻatosina atu foʻi le Generative AI i galuega faʻakemisi, e le naʻo le mafaufauina o molekiu.
E mafai e fuafuaga o le retrosynthesis ona:
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fautuaina auala i se nofoaga fa'amoemoeina
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fautua atu mea amata e maua faapisinisi
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fa'avasega auala e tusa ai ma le aofa'i o la'asaga po'o le gafatia e iloa
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fesoasoani i le au fa'atau vaila'au e vave fa'ate'a ese manatu "manaia ae le mafai" AiZynthFinder 2020 Coley 2018 (CASP)
E mafai ona sefe ai le taimi moni, aemaise lava pe a e suʻesuʻeina le tele o fausaga talafeagai. Ae ui i lea, e taua tele tagata iinei ona:
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suiga i le maua o le reagent
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o popolega i le saogalemu ma le fua e moni lava
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o nisi laasaga e foliga lelei i luga o le pepa ae e masani ona toilalo
O se fa'ata'ita'iga e le atoatoa, ae o le a ou fa'aaogaina lava: retrosynthesis O le AI e pei o se GPS e toetoe lava sa'o, vagana ai o nisi taimi e fa'atonutonu oe i se vaituloto ma fa'amaonia o se auala 'alo. 🚗🌊 Coley 2017 (retrosynthesis fesoasoani komepiuta)
Fa'amaumauga, fa'ata'ita'iga multimodal, ma le mea moni faigata o fale su'esu'e 🧾🧪
E fiafia le Generative AI i faʻamaumauga. E gaosia e fale suʻesuʻe faʻamaumauga. I luga o pepa, e foliga faigofie lava lena mea.
Ha. Leai.
O faʻamatalaga moni o le fale suʻesuʻe e faapea:
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le atoatoa
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pisapisaō
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tumu i aafiaga fa'aputuga Leek et al. 2010 (aafiaga fa'aputuga) Nature 2024 (aafiaga fa'aputuga i le fa'ata'ita'iga o sela)
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ua salalau solo i faatulagaga eseese
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fa'amanuiaina i tu ma aga fa'aigoaina "foafoa"
E mafai e faiga fa'atuputupu tele ona tu'ufa'atasia:
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taunuuga o le suʻega
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fausaga fa'akemikolo
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ata (microscope, histology)
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omics (transcriptomics, proteomics)
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tusitusiga (fa'atonuga, ELN, lipoti) npj Foma'i Fa'atekinolosi 2025 (multimodal i biotech) Su'esu'ega o Ata Fa'afoma'i 2025 (multimodal AI i vaila'au)
A aoga, e ofoofogia. E mafai ona e fa'aalia ni mamanu e le o manino ma fa'atulaga ni fa'ata'ita'iga e ono misia e se tagata tomai fa'apitoa.
A lē manuia, e lē manuia foʻi. E lē tapunia le faitotoʻa. E na o le tuleia oe i se faʻaiʻuga sese ma le mautinoa. O le mafuaʻaga lea e lē o se filifiliga le pulega, faʻamaoniga, ma le iloiloga o vaega. Taiala a fomaʻi (faʻaaliga taufaʻasesē) npj Digital Medicine 2025 (faʻaaliga taufaʻasesē + faʻavae saogalemu)
Lamatiaga, tapula'a, ma le vaega "aua ne'i fa'asesēina oe i le tautala lelei" ⚠️
Afai e na'o le tasi le mea e te manatua, ia manatua lenei mea: o le fa'atupuina o le AI e fa'atauanau. E mafai ona sa'o lona leo ae sese. Taiala a foma'i (fa'aaliga taufa'ase'e)
Tulaga lamatia autu:
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Faiga fa'afoliga : fa'ata'ita'iga fa'apitoa e le moni Ta'iala a foma'i (fa'afoliga)
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Fa'asalalauina o fa'amaumauga : faia o se mea e latalata tele i mea ua iloa USENIX 2021 (ave'esea o fa'amaumauga o a'oa'oga) Vogt 2023 (popolega i mea fou/tulaga ese)
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Fa'aleleia atili : tuliloaina o togi na valoia e le fa'aliliuina i totonu o le vitro Nature 2023 (iloiloga o le mauaina o le ligand)
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Fa'aitu'au : fa'amaumauga o a'oa'oga ua fa'asaga i nisi o chemotypes po'o sini Vogt 2023 (iloiloga o fa'ata'ita'iga + fa'aitu'au/fou)
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Mea fou sese : mole mole "fou" o ni eseesega faigofie Vogt 2023
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Va i le fa'amatalaina : faigata ona fa'amaonia fa'ai'uga i pa'aga Mataupu fa'avae o le fa'amaoniga a le OECD QSAR
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Popolega i le saogalemu ma le IP : faʻamatalaga taua o le polokalame i faʻamatalaga 😬 USENIX 2021 (aveeseina o faʻamatalaga o aʻoaʻoga)
Fa'aitiitiga e fesoasoani i le fa'atinoga:
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taofi tagata i le faiga o faaiuga
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fa'amatalaga ma fa'amatalaga o le log mo le mafai ona su'eina
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fa'amaonia i metotia orthogonal (assays, fa'ata'ita'iga eseese)
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fa'amalosia fa'atapula'a ma fa'amama otometi
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ia taulimaina taunuuga e pei o ni manatu faavae, ae le o ni upu moni Taiala a le OECD QSAR
O le Generative AI o se meafaigaluega eletise. E lē avea meafaigaluega eletise ma se kamuta… e vave ona latou faia ni mea sese pe afai e te lē iloa le mea o loʻo e faia.
Auala e faʻaaogaina ai e 'au le AI faʻatuputupu e aunoa ma le vevesi 🧩🛠️
E masani ona manaʻo 'au e faʻaaoga lenei mea e aunoa ma le liua o le faʻalapotopotoga i se faʻaaliga saienisi. O se auala faʻatino e faʻapenei:
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Amata i le tasi le fa'alavelave (fa'alauteleina o le osofa'iga, gaosiga fa'a-analog, fa'avasegaina o tusitusiga) Nature 2023 (iloiloga o le mauaina o le ligand)
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Fausia se taamilosaga iloiloga fa'apitoa (fa'amama + fa'apipi'i + siakiina o meatotino + iloiloga o vaila'au) REINVENT 4 AiZynthFinder 2020
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Fuafua taunuuga (taimi ua sefe, fua faatatau o le aafiaga, faaitiitia o le alu ese) Waring 2015 (alu ese)
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Tuufaatasia ma meafaigaluega o loʻo iai nei (ELN, resitala faʻaputuga, faʻamaumauga o suʻega) Punaoa ELN a Edinburgh
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Fausia tulafono fa'aaogā (mea e mafai ona fa'amalosia, mea e le o iai i le initaneti, toe iloilo la'asaga) USENIX 2021 (lamatiaga o le aveeseina o fa'amatalaga)
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Aoao tagata ma le agamalu (o le mea moni, o le tele o mea sese e mafua mai i le faaaoga sese, ae le o le faataitaiga) Taiala a fomaʻi (faaaliga sese)
E le gata i lea, aua le fa'atauva'aina le aganu'u. Afai e lagona e le au fa'atau vaila'au o lo'o tuleia i latou e le AI, o le a latou le amana'iaina. Afai e sefe ai lo latou taimi ma fa'aaloalo i lo latou tomai, o le a vave ona latou fa'aaogaina. E malie fo'i tagata fa'apena 🙂.
O le ā le matafaioi a le generative AI i le Drug Discovery pe a e fa'alatalata ese? 🔭
A fa'alauteleina, o le matafaioi e le o le "suia o saienitisi." Ae o le "fa'alauteleina o le lautele o le saienisi." Nature 2023 (iloiloga o le mauaina o le ligand)
E fesoasoani i 'au:
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su'esu'e nisi manatu fa'avae i vaiaso ta'itasi
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fautuaina nisi fausaga sui tauva i le taamilosaga taitasi
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fa'amuamua fa'ata'ita'iga ma le atamai
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fa'apipi'i fa'asolosolo i le va o le mamanu ma le suega
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fefa'asoaa'i le malamalama i vaega eseese o le silos. Mamanu 2025 (LLM i le mauaina o vaila'au)
Ma atonu o le vaega e sili ona lē amana’iaina: e fesoasoani ia te oe e aua le fa’aumatia le fatufatuga taugata a tagata i galuega faifai pea. E tatau i tagata ona mafaufau i le faiga, fuafuaga, ma le fa’auigaga - ae lē o le fa’aaluina o aso e faia ai ni lisi o fesuia’iga i lima. Nature 2023 (iloiloga o le mauaina o le ligand)
Ioe, o le matafaioi a le generative AI i le Drug Discovery o se fa'atelevaveina, o se generator, o se faamama, ma o nisi taimi o se fa'alavelave. Ae o se mea taua.
Aotelega Fa'ai'u 🧾✅
Ua avea le Generative AI ma se gafatia autu i le sailiga o fualaau faasaina i aso nei ona e mafai ona gaosia ni molela, ni manatu, ni faasologa, ma ni auala e vave atu nai lo tagata - ma e mafai ona fesoasoani i 'au e filifili ni faataitaiga sili atu. Iloiloga o le Frontiers in Drug Discovery 2024 Nature 2023 (iloiloga o le sailiga o le ligand)
Otootoga o fa'amatalaga:
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E sili ona lelei i le amataga o le sailiga ma le faʻaleleia atili o taʻitaʻiga ⚙️ REINVENT 4
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E lagolagoina ai molela'au laiti ma mea fa'aolaola GENTRL (Nature Biotech 2019) ProteinMPNN (Science 2022)
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E faʻaleleia atili ai le gaosiga e ala i le faʻalauteleina o le auala e faʻalauiloa ai manatu Nature 2023 (iloiloga o le mauaina o le ligand)
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E manaʻomia ni tapulaʻa, faʻamaoniga, ma tagata e ʻalofia ai le leai o se faʻamaoni Mataupu faʻavae o le OECD QSAR Taʻiala a fomaʻi (faʻaaliga taufaʻasesē)
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O manumalo tetele e sau mai le tu'ufa'atasia o le workflow , ae le o le marketing froth Nature 2023 (ligand discovery review)
Afai e te taulimaina e pei o se pa'aga fa'atasi - ae le o se oracle - e mafai ona fa'agaoioia moni lava polokalame. Ma afai e te taulimaina e pei o se oracle ... ia, atonu e te toe mulimuli i lena GPS i le vaituloto. 🚗🌊
Fesili e Masani Ona Fesiligia
O le ā le matafaioi a le generative AI i le mauaina o fualaau faasaina?
E fa'alauteleina e le Generative AI le auala e fa'atino ai manatu i le amataga o le sailiga ma le fa'aleleia atili o le ta'ita'iga e ala i le fautuaina o molela'au sui, fa'asologa o porotini, auala e fa'atino ai, ma manatu fa'apitoa fa'aola. O le taua e itiiti ifo i le "suia o fa'ata'ita'iga" ma sili atu i le "filifili o fa'ata'ita'iga sili atu" e ala i le faia o le tele o filifiliga ona fa'amama malosi lea. E sili ona galue o se fa'atelevaveina i totonu o se faiga fa'atino fa'atonutonu, ae le o se tagata e tuto'atasi e faia fa'ai'uga.
O fea e sili ona lelei ai le faatinoga o le generative AI i le faagasologa atoa o le sailia o fualaau faasaina?
E masani ona tuʻuina atu le tele o le taua pe a tele le avanoa o le manatu ma taugata le faʻataʻitaʻiga, e pei o le faʻailoaina o le osofaʻiga, le mamanu fou, ma le faʻaleleia atili o taʻitaʻi. E faʻaaogaina foʻi e 'au mo le faʻavasegaina o le ADMET, fautuaga o le retrosynthesis, ma le lagolagoina o tusitusiga poʻo le manatu. O faʻamanuiaga sili ona tele e masani ona sau mai le tuʻufaʻatasia o le gaosiga ma faamama, togi, ma iloiloga a tagata nai lo le faʻamoemoe o se faʻataʻitaʻiga e tasi e "atamai."
E faʻapefea ona e faʻatulaga ni tapulaʻa ina ia le maua ai e faʻataʻitaʻiga faʻatupu ni molelaʻau le aoga?
O se auala aoga o le faʻamatalaina lea o tapulaʻa aʻo leʻi faia le gaosiga: vaega o meatotino (e pei o le solubility poʻo le logP targets), tulafono o le scaffold poʻo le substructure, binding-site features, ma tapulaʻa fou. Ona faʻamalosia lea o le medicinal chemistry filters (e aofia ai PAINS/reactive groups) ma siaki o le synthesizability. O le constraint-first generation e fesoasoani tele i le diffusion-style molecular design ma frameworks e pei o le REINVENT 4, lea e mafai ona faʻailogaina ai sini e tele-objectives.
E fa'apefea ona fa'amaonia e 'au ia galuega faatino a GenAI e 'alofia ai le fa'aaliga sese ma le soona mautinoa?
Ia taulimaina ia taunuuga uma e pei o se manatu faavae, ae le o se faaiuga, ma faamaonia i suega ma faataitaiga orthogonal. Faapipii le gaosiga ma le faamama malosi, faapipiiina po o le togi pe a talafeagai ai, ma siaki o le vaega talafeagai mo faailoilo QSAR. Ia faailoa atu le le mautonu pe a mafai, aua e mafai ona sese ma le mautinoa faataitaiga i luga o kemisi i fafo atu o le tufatufaina po o tagi le mautinoa o meaola. O le iloiloga o le tagata-i-le-taamilosaga o loo tumau pea o se vaega autu o le saogalemu.
E fa'apefea ona e puipuia le tafe o fa'amaumauga, lamatiaga o le IP, ma fa'amatalaga "taulotoina"?
Faaaoga le pulega ma le puleaina o avanoa ina ia aua ne'i tuu fa'afuase'i fa'amatalaga taua o polokalame i totonu o fa'amatalaga fa'aosofia, ma fa'amaumau fa'amatalaga/fa'ai'uga mo le su'esu'eina. Fa'amalosia siaki fou ma tutusa ina ia aua ne'i nonofo latalata tele sui tauva ua faia i ni vaega ua iloa po'o ni vaega puipuia. Tausia tulafono manino e uiga i fa'amatalaga e fa'atagaina i totonu o faiga i fafo, ma ia sili atu le fiafia i siosiomaga fa'atonutonu mo galuega e maualuga le maaleale. O le iloiloga a tagata e fesoasoani e vave maua ai fautuaga "masani tele".
E faʻapefea ona faʻaaogaina le generative AI mo le faʻaleleia atili o taʻiala ma le faʻatulagaina o le tele o parakalafa?
I le faʻaleleia atili o le taʻitaʻiga, e taua tele le generative AI auā e mafai ona fautuaina ni fofo faʻatauvaʻa se tele nai lo le tuliloaina o se mea e tasi e "atoatoa". O galuega masani e aofia ai le fautuaga analog, suʻesuʻega o mea e sui ai, ma le faʻasolosolo o le scaffold pe a poloka e le potency, tox, poʻo IP faʻatapulaʻaina le alualu i luma. E mafai ona maaleale mea e vaʻaia ai meatotino, o lea e masani ona faʻavasega e 'au sui tauva ma le tele o faʻataʻitaʻiga ona faʻamaonia lea o filifiliga sili ona lelei i faʻataʻitaʻiga.
E mafai fo'i e le generative AI ona fesoasoani i le biologics ma le protein engineering?
Ioe - e fa'aaogaina e 'au mo le faia o le fa'asologa o antibody, manatu mo le matua o le affinity, fa'aleleia atili o le mautu, ma le su'esu'eina o enzyme po'o peptide. E mafai ona foliga mai e talafeagai le faia o porotini/fa'asologa e aunoa ma le mafai ona atia'e, o lea e taua ai le fa'aogaina o le developability, immunogenicity, ma le manufacturability filters. E mafai e meafaigaluega fa'atulagaina e pei o le AlphaFold ona lagolagoina le mafaufau, ae o le "fa'atulagaga talafeagai" e le o se fa'amaoniga o le fa'aalia, galuega, po'o le saogalemu. E tumau pea le taua o Wet-lab loops.
E faʻapefea ona lagolagoina e le generative AI le fuafuaina o le faʻasologa ma le toe faʻatulagaina?
E mafai e le au fuafuaina o le retrosynthesis ona fautuaina ni auala, mea e amata ai, ma le fa'avasegaina o auala e fa'avave ai mafaufauga ma vave ona taofia ai ni auala e le mafai ona fa'atino. O meafaigaluega ma auala e pei o le fuafuaga fa'a-AiZynthFinder e sili ona aoga pe a fa'apipi'i fa'atasi ma siaki moni o le mafai ona fa'atino mai le au fa'atau vaila'au. O le maua, saogalemu, fa'atapula'aina o le fa'ateleina, ma "tali atu i pepa" e le manuia i le fa'atinoina e mana'omia pea le fa'amasinoga a le tagata. A fa'aaogaina i lenei auala, e sefe ai le taimi e aunoa ma le fa'atagā ua foia le vaila'au.
Fa'asinomaga
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Natura - Iloiloga o le mauaina o le Ligand (2023) - nature.com
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Tekonolosi Fa'alenatura - GENTRL (2019) - nature.com
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Natura - AlphaFold (2021) - nature.com
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Natura - RFdiffusion (2023) - nature.com
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Tekonolosi Fa'alenatura - ProteinGenerator (2024) - nature.com
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Fesootaiga Faanatura - Aafiaga fa'aputu i le fa'ata'ita'iga o sela (2024) - nature.com
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Foma'i Fa'atekinolosi npj - Fa'aaliga Fa'alilolilo + fa'avae saogalemu (2025) - nature.com
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Foma'i Fa'atekinolosi npj - Multimodal i le biotech (2025) - nature.com
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Saienisi - ProteinMPNN (2022) - science.org
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Fa'ata'ita'iga o le Sela - LLM i le mauaina o vaila'au (2025) - cell.com
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ScienceDirect (Elsevier) - Fa'ata'ita'iga fa'atupuina i le mamanuina o vaila'au fou (2024) - sciencedirect.com
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ScienceDirect (Elsevier) - Vogt (2023): popolega i mea fou/tulaga ese - sciencedirect.com
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Su'esu'ega o Ata Fa'afoma'i (ScienceDirect) - Multimodal AI i vaila'au (2025) - sciencedirect.com
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PubMed Central - Taiala a fomaʻi (lamatiaga o mafaufauga sese) - nih.gov
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Tala o Suʻesuʻega Faʻakemikolo (Lomiga a le ACS) - Vateatea Faʻakemikolo (2015) - acs.org
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Tuaoi i le Mauaina o Fualaau Faasaina (PubMed Central) - Iloiloga (2024) - nih.gov
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Journal of Chemical Information and Modeling (ACS Publications) - Fa'ata'ita'iga fa'asalalau i le mamanuina o vaila'au fou (2024) - acs.org
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PubMed Central - REINVENT 4 (fa'avae tatala) - nih.gov
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PubMed Central - ADMETlab 2.0 (e taua le ADMET i le amataga) - nih.gov
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OECD - Mataupu Faavae mo le Fa'amaoniga mo Fa'amoemoega Fa'atonutonu o Fa'ata'ita'iga (Q)SAR - oecd.org
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OECD - Pepa taiala i le faamaoniga o faataitaiga (Q)SAR - oecd.org
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Tala o Suʻesuʻega Faʻakemikolo (Lomiga a le ACS) - Fuafuaga Faʻaputuga Faʻakomepiuta / CASP (Coley, 2018) - acs.org
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Saienisi Tutotonu a le ACS (ACS Publications) - Toe fa'afouina fa'akomepiuta (Coley, 2017) - acs.org
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PubMed Tutotonu - AiZynthFinder (2020) - nih.gov
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PubMed - Waring (2015): fa'aitiitia o le malosi - nih.gov
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PubMed Central - Leek et al. (2010): aafiaga fa'aputuga - nih.gov
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Ofisa o Fualaau Fa'asaina a Europa - Aotelega o le taiala a le ICH E14/S7B - europa.eu
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USENIX - Carlini et al. (2021): fa'aputuina o fa'amaumauga o a'oa'oga mai fa'ata'ita'iga gagana - usenix.org
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Iunivesite o Edinburgh – Auaunaga Suesuega Faatekinolosi - Punaoa o le api tusi faaeletoronika (ELN) - ed.ac.uk
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ScienceDirect (Elsevier) - Weaver (2008): Vaega fa'aoga o le QSAR - sciencedirect.com